1005个碱基!下一代DNA合成先驱Ansa从头合成世界最长寡核苷酸

当地时间 3 月 9 日,下一代 DNA 合成先驱 Ansa Biotechnologies)宣布成功从头合成 1005 个碱基的 DNA 序列,这是目前世界上单次合成最长的 DNA 寡核苷酸,也是该领域的一个重要里程碑。

据了解, Ansa 合成的 DNA 序列不仅长,还包含复杂的特征,包括二级结构和高 GC 含量,编码用于基因治疗开发的 AAV 载体的关键部分。使用标准的分子生物学技术克隆 “Ansamer™”寡核苷酸发现,它含有大约 28% 的序列完美分子,表明在其合成过程中,平均分步产量约为 99.9%,处于行业领先地位。

相对来说,传统的化学合成法单次仅能合成 200~300 bp 的 DNA 片段,想要合成更长的片段,就需要将短片段不断地拼接组装,错误率和成本都大大提升,更是难以处理上面提到的复杂的特征。

Ansa 成立于 2018 年,总部位于加利福尼亚州埃默里维尔。Ansa 的核心技术是一种基于酶的新型 DNA 合成方法,由公司联合创始人 Daniel Lin-Arlow 和 Sebastian Palluk 共同开发,相关论文以题 “De novo DNA synthesis using polymerase-nucleotide conjugates” 于 2018 年 6 月发表在 Nature Biotechnology 上 ,Jay D. Keasling 为文章共同通讯作者之一。

该技术使用一种与模板无关的工程化聚合酶,这种聚合酶与一个三核苷分子缀合,从而一次可快速构建一个碱基的 DNA 序列,与其他基于游离核苷酸的酶促合成方法相比,在成本、速度和灵活性方面具有显著优势。

Ansa 方法的特别之处还在于合成过程的所有步骤均使用非常精确的酶而不是刺激性化学物质,因此在制造时,它不会破坏正在扩增的 DNA,从而能够直接合成数百甚至数千个碱基长的序列。这些长分子简化了更长序列的构建,并极大地促进了 “复杂” 序列的构建,这些序列为新兴的合成生物学应用提供动力,但目前的供应商很难生产。

此外,Ansa 正在开发一系列高度多路复用的定制仪器和信息学,以满足特定生产能力和下游应用的需要。

▲图丨Ansa 融资情况(来源:crunchbase)

公司方面透露,他们计划在 4 月份启动克隆合成基因的早期访问计划。联合创始人 Lin-Arlow 曾在接受媒体采访时表示,想为 DNA 创建类似 Amazon Prime 的服务。

如今,细胞和基因治疗、蛋白质工程、生物制造以及基础生命科学等领域的研究对长片段 DNA 合成的需求不断增加。

2022 年 2 月,中国科学家也在酶促 DNA 合成方面实现了重大突破,中科院天工所江会锋团队创建了两步酶促 DNA 合成技术,将合成准确率提高至 98.7%,且有望将成本降低 2~3 个数量级,相关公司中合基因近期已完成数千万元天使轮融资。

参考链接:

1.https://www.nature.com/articles/Nbt.4173

2.https://www.businesswire.com/news/home/20230309005124/en/Ansa-Biotechnologies-Announces-Successful-de-novo-Synthesis-of-World%E2%80%99s-Longest-Oligonucleotide-at-1005-Bases

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